新一代测序用于传染病监控

基因组学正在扩大我们对病原体进化、宿主-病原体相互作用以及抗生素耐药性的了解。基因组学也在改变现代传染病的监控，以及公共卫生专家用来防止各大疾病（如结核病、HIV和流感）流行和大流行的方法。

目前评估传染源的方法包括基于抗体的检测、实时定量PCR、脉冲场凝胶电泳（PFGE）以及多位点序列分型（MLST）。这些方法通常只适用于少数有限的生物，且数据分析很主观。